** VENDOR RESPONSE **
Dear Patrizia,
Are you certain this is not due to
autofluorescence contributed by the cells or the doxorubicin? If you haven’t
yet, I would suggest trying to image a no-dye control and see if it gives off a
fluorescent signal at that wavelength.
Jason
Jason A. Kilgore
Molecular Probes Tech Support
From: Confocal
Microscopy List [mailto:[hidden email]] On Behalf Of Casalini Patrizia
Sent: Wednesday, January 21, 2009
1:46 AM
To:
[hidden email]
Subject: Nuclear staining
Dear all,
I have to detect Doxorubicin in frozen tissue tumors from
treated vs untreated mice. I counterstained nuclei either with YOYO-1 after
permeabilization with 0.1% Triton or with SYBRGreen-1 with no permeabilization.
I set up sequential acquisition method with confocal
BioRad2000 system as follows:
PMT1 Ex= 488; Em = BP 515/30.
PMT2 Ex= 488; Em = BP 600/50.
Could someone explain me why I still detect a strong signal
with PMT2, even though there is the emission BP filter, in both cases (YOYO1 or
SYBR green)? Given that the signal is present also in untreated samples, it can
be due only to nuclear staining, can’t it?
Thanks,
Patrizia
.......................................................................
Dr. Patrizia
Casalini
Molecular Biology
Unit
Experimental
Oncology Dept.
Fondazione IRCCS Istituto
Nazionale dei Tumori
Via Venezian, 1. 20133 Milano - Italy
Phone: +39 02 23902563, Fax: +39 02
23903073
E-mail: [hidden email]
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